Наявність в Єдиному реєстрі податкової накладної з помилками спричиняє розбіжності між даними Єдиного реєстру та реєстру виданих податкових накладних платника податку — продавця. Ці розбіжності є податковою інформацією, що свідчить про можливі порушення платником податків податкового законодавства, контроль за дотриманням якого покладено на органи ДПС. Якщо платник не надасть пояснення щодо суті таких розбіжностей та документальні підтвердження своїх пояснень на обов’язковий письмовий запит органу ДПС протягом 10 робочих днів з дня отримання запиту, це є однією з обставин, за наявності якої здійснюється документальна позапланова перевірка платника податку відповідно до пп. 78.1.1 статті 78 розділу ІІ ПКУ.
З відповідей начальника управління оподаткування юридичних осіб ДПС у Львівській області Василя Васильовича Кресяка під час «гарячої лінії» з платниками податків 23 травня 2012 року