ДФС у листі від 21.10.2015 р. №22218/6/99-99-19-03-02-15 зазначила: якщо під час організації перевезень вантажів за дорученням клієнта є необхідним отримання державних платних послуг від органів виконавчої влади, які своєю чергою звільняються від оподаткування ПДВ, то експедитор на дату визначення податкових зобов’язань з ПДВ складає дві податкові накладні:
- одну - на вартість експедиторських послуг із нарахуванням ПДВ за ставкою 20 %,
- другу - на вартість державних платних послуг із застосуванням режиму звільнення від оподаткування.
Обидві податкові накладні підлягають обов’язковій реєстрації в ЄРПН.
Аналогічне розяснення надало й ГУ ДФС у м. Києві у листі від 27.10.2015 р. №16269/10/26-15-15-01-09.