Платник податку може прийняти самостійно рішення про зарахування в повному обсязі належної йому суми бюджетного відшкодування або її частини у зменшення податкових зобов’язань з цього податку, що виникли протягом наступних звітних (податкових) періодів. Зазначене рішення відображається платником податку у податковій декларації, яку він подає за результатами звітного (податкового) періоду, в якому виникає право на подання заяви про отримання бюджетного відшкодування. У разі прийняття такого рішення зазначена сума не враховується при розрахунку сум бюджетного відшкодування наступних звітних (податкових) періодів (п.200.6 ст.200 Податкового кодексу України (далі – ПКУ)).
Територіальний орган Міндоходів проводить перевірку заявлених платником податку сум бюджетного відшкодування.
У разі якщо платник податків подає уточнюючий розрахунок до податкової декларації, поданої за період, що перевірявся, відповідний контролюючий орган має право на проведення позапланової перевірки платника податків за відповідний період (п.50.3 ст.50 ПКУ).
Враховуючи зазначене, якщо платник податків подає уточнюючий розрахунок до податкової декларації з ПДВ, яким зменшується сума бюджетного відшкодування, що вже йому відшкодована, та щодо якої податковим органом було проведено перевірку, то в такому випадку в контролюючого органу є підстави для проведення позапланової перевірки такого платника податків за відповідний період.