Фахівці ДФСУ в інформаційно-довідковому ресурсі "ЗІР" (категорія 101.17) роз'яснили: враховуючи те, що платник ПДВ, до складу якого входять філії та/або структурні підрозділи, не делегував їм право складання податкових накладних, та при цьому, такі філії та/або структурні підрозділи здійснюють операції з використанням касових апаратів, то податкова накладна повинна складатися за щоденними підсумками операцій до кожного касового апарата окремо.
При цьому, такі податкові накладні складаються від імені платника податку (головного підприємства).
Про особливості складання податкових накладних за щоденними підсумками операцій податківці також розповідали тут, а фахівці "Дебету-Кредиту" в аналітичній статті ось тут (для передплатників).