Згідно з Типовим положенням про бухгалтерську службу бюджетної установи головний бухгалтер призначається на посаду і звільняється з посади відповідно до законодавства про працю.
Прийом (передача) справ головним бухгалтером у разі призначення на посаду або звільнення з посади здійснюється після проведення внутрішньої перевірки стану бухгалтерського обліку та звітності, за результатами якої оформляється відповідний акт. Копія такого акта направляється бюджетній установі, якій підпорядковується бюджетна установа .
Головний бухгалтер у разі невиконання або неналежного виконання покладених на нього повноважень несе відповідальність згідно із законами.
Позбавлення премій, передбачених системою оплати праці, здійснюється відповідно до положення про преміювання, чинним на підприємстві, і може здійснюватися тільки за той розрахунковий період, в якому було допущено порушення. Таке позбавлення премій оформляється наказом керівника підприємства, організації з обов'язковим зазначенням конкретних обставин, що стали причиною депреміювання.